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待机阶段
 
沉淀之后到下个周期开始的期间称为待机工序。
根据需要可进行搅拌或瀑气。在多池系统中，待机的目的是在转向另一个单元前为一个反应器提供时间以完成它的整个周期。待机不是一个必需的步骤，可以去掉。
 
在待机期间根据工艺和处理目的；可以进行曝气、混合、去除剩余污泥。待机期的长短由处理水量决定。
排除剩余污泥sBR运行中另一个重要步骤，它并不作为五个基本过程之一，这是因为排故剩余污泥的时间不确定。与传统的连续式系统一样，排除剩余污泥的量和频率由运行要求决定。
有效的防止污泥膨胀
 
底物浓度梯度大，是控制膨胀的重要因素。完全混合式反应器里基本没有浓度梯度丝状茵含量高，极易膨胀，属于推流式反应器的SBR系统浓度梯度很大，丝状茵含量低，不易膨胀。
SBR系统进水阶段和反应阶段的缺氧（厌氧）和好氧状态的交替，能抑制专性好氧的丝状菌的过量繁殖，而控制膨胀。
 
 
 
BOD的去除
 
SBR系统的一个重要优点是操作者通过控制有关条件可保持微生物的选择性。在一个完整的处理周期内，微生物选择压变化大．这些选择压包括氧气和基质的可获性。
尽管在一些传统的连续式系统中也会出现这些选择压中的某一种情况，而SBR系统具有很好的选择和拓展能力，允许微生物在优越的环境中生长。